DNA配列上で実験操作を試し、ゲノム解析を進める
IMCは、DNA配列上でクローニング実験やゲノム解析をシミュレーション・可視化する研究用ソフトウェア。GenomeTravelerのNGS解析機能はIMC Premium-Omics Editionに統合されています。
しくみ
解こうとしている課題
DNA配列を使ったクローニング実験やゲノム解析では、配列情報と実験操作、解析結果を扱う必要があります。同社は、これらの操作・解析・表示をソフトウェア上で行えるようにすることを目的として説明しています。
どう動くか
配列データを読み込み、制限酵素切断、PCRプライマー設計、ライゲーション、電気泳動などの操作を画面上で実行します。切断片の末端形状を保持し、相補的な末端を持つ断片同士を結合対象にします。ゲノム注釈、相同性検索、比較ゲノム解析や、NGSデータの解析にも対応します。会社は、実験操作と配列解析を同じ環境で扱え、ゲノムマップを柔軟に作成できる点を特徴として説明しています。
できるようになること
同社は、クローニングやゲノム解析をコンピュータ上で操作・可視化することで、分子生物学の研究や教育を支援すると説明しています。実験前の配列操作の検討や、ゲノム情報の比較・表示に利用できます。
技術の出自:奈良先端科学技術大学院大学の協力を得て開発。会社サイトでは東京工業大学の協力も記載。大学の特定の学部・研究プロジェクト名は確認できず。 出典1 出典2 出典3
使われる場面
- 分子生物学実験の設計・学習
- DNAクローニングのシミュレーション
- 遺伝子・ゲノム配列解析と注釈
- 比較ゲノム解析とゲノムマップ作成
- 遺伝子発現・アレイデータ解析
- NGSデータのアセンブリ・マッピング・解析
- ゲノム設計・代謝解析
優位性の主張
製品・サービス
DNAクローニングのシミュレーション、配列注釈、相同性検索、ゲノム解析・比較、マップ表示などを行う研究用ソフトウェア。 出典
IMCの解析機能に、旧GenomeTravelerのNGSシーケンス・マッピングなどの機能を統合したエディション。 出典
次世代シーケンサーや第三世代シーケンサーの配列解析ソフト。機能はIMC Premium-Omics Editionに統合。 出典